Dù mang nhiều lợi ích, ngành sản xuất ớt ở Việt Nam vẫn đối mặt với những thách thức như: biến đổi khí hậu làm giảm năng suất, sâu bệnh ảnh hưởng chất lượng, đầu ra bấp bênh. Việc lạm dụng thuốc bảo vệ thực vật cũng ảnh hưởng uy tín xuất khẩu.Từ hàng ng