Về vũ khí, ninja sử dụng nhiều loại công cụ đặc biệt như shuriken (phi tiêu), kunai (dao găm), dây thừng, thuốc nổ nhỏ, ống thổi độc và các loại vũ khí cải tiến từ dụng cụ nông nghiệp. Khả năng chiến đấu không nằm ở độ lớn của vũ khí mà ở cách sử dụng c