Dù đã có nhiều tiến bộ trong quan sát và mô hình hóa, nhưng mắt bão vẫn là một thách thức lớn đối với các nhà khí tượng học. Mắt bão không phải lúc nào cũng tồn tại rõ ràng; đôi khi nó bị che phủ hoặc biến mất do tác động của yếu tố địa hình, tương tác