Người chơi bắt đầu hành trình với nhân vật chính – Thám tử Mino – một con chuột trẻ từng là học trò của thám tử huyền thoại Mouseholm. Cốt truyện mở đầu bằng việc một con chuột con tên Tika bị mất tích trong hoàn cảnh bí ẩn. Khi điều tra, Mino phát hiện