Mặc dù chuối hoang dã có giá trị lớn về mặt di truyền và bảo vệ môi trường, nhưng hiện nay chúng đang đối mặt với nhiều thách thức. Quá trình phát triển nông nghiệp và khai thác tài nguyên rừng đã làm giảm diện tích rừng tự nhiên, nơi chuối hoang dã có