Lagoon Vĩ Đại là nơi sinh sống của hàng trăm loài thủy sản, chim nước, cỏ thủy sinh, và nhiều loài động vật đặc hữu. Các hệ sinh thái điển hình gồm: rừng ngập mặn ven phá, cỏ biển, bãi bồi, đầm lầy và hệ sinh thái nước lợ.Việc bảo tồn hệ sinh thái đầm p