Mặc dù SIêu X mang lại rất nhiều lợi ích, nhưng nó cũng đặt ra không ít thách thức và rủi ro. Một trong những vấn đề lớn nhất chính là việc mất kiểm soát đối với các hệ thống này. Nếu không được kiểm soát chặt chẽ, SIêu X có thể trở thành công cụ của cá