Mặc dù Lễ hội trái cây đã có những thành công nhất định, nhưng trong quá trình tổ chức, vẫn tồn tại một số thách thức cần được giải quyết. Một trong những thách thức lớn nhất là việc bảo vệ môi trường trong suốt quá trình tổ chức lễ hội. Việc sử dụng qu