Sói Hokkaido được coi là một phân loài của sói xám có nguồn gốc từ lục địa Á-Âu, di cư đến Nhật Bản qua cầu đất nối liền giữa đảo Hokkaido và Siberia trong thời kỳ băng hà cuối cùng. Sau khi mực nước biển dâng cao, cầu đất bị nhấn chìm, và quần thể sói