Cơ chế điều khiển trong KM Marble Đại Chiến khá đơn giản nhưng yêu cầu sự chính xác và nhanh nhạy. Người chơi chỉ cần sử dụng các phím di chuyển hoặc chạm màn hình để điều khiển viên bi di chuyển trên chiến trường. Tuy nhiên, mỗi viên bi có một phạm vi