Mặc dù ngành chăn nuôi bò và gia súc có tầm quan trọng lớn, nhưng cũng không thiếu những thách thức mà người chăn nuôi phải đối mặt. Một trong những vấn đề nổi cộm là dịch bệnh. Các loại bệnh như lở mồm long móng, bệnh tả lợn châu Phi, hay bệnh viêm da