Kỹ năng tay không (taijutsu) cũng là một phần quan trọng, cho phép họ tự vệ và tấn công trong khoảng cách gần. Tuy nhiên, điều khiến ninja trở nên nổi bật là khả năng ngụy trang và ẩn thân. Họ có thể biến mất trong bóng tối, lẩn trốn sau bụi cây hay hòa