Tuy nhiên, hệ thống này không phải là không có giới hạn. Trong những thời điểm bị tấn công dồn dập, Vòm Sắt vẫn có thể bị quá tải. Ngoài ra, việc triển khai toàn diện để bảo vệ mọi khu vực dân cư đều đòi hỏi chi phí lớn, điều mà ngay cả một quốc gia phá