Mặc dù nghề ngư đồng câu cá mang lại nhiều lợi ích, nhưng cũng đối mặt với không ít khó khăn. Một trong những thách thức lớn nhất là sự ô nhiễm môi trường nước. Nước sông, hồ và biển đang ngày càng bị ô nhiễm bởi các chất thải công nghiệp và sinh hoạt,