Sự gia tăng của chất thải sinh hoạt, nước thải công nghiệp và thuốc bảo vệ thực vật từ các trang trại nông nghiệp khiến chất lượng nước trong đầm ngày càng suy giảm. Hiện tượng phú dưỡng hóa gây ra tảo nở hoa (bloom), ảnh hưởng trực tiếp đến sức khỏe hệ