Mystery Mice đã đạt được sự công nhận từ cả giới phê bình lẫn cộng đồng game thủ không chỉ nhờ cốt truyện mà còn vì giá trị giáo dục và nhận thức xã hội mà nó mang lại. Trò chơi thường được sử dụng như công cụ hỗ trợ cho các khóa học phát triển kỹ năng