Một trong những đặc điểm nổi bật của chuột trong Mystery Mice là trí thông minh sắc sảo. Không chỉ giỏi suy luận logic, các nhân vật còn thành thạo trong việc sử dụng công nghệ cổ và hiện đại, từ việc giải mật mã, vận hành máy móc cho đến tìm đường tron