Dù Bách Gia Lạc mang lại nhiều giá trị tích cực, song cũng tồn tại một số giới hạn. Việc quá thiên về dung hòa đôi khi làm mất đi tính rõ ràng, thiếu quyết đoán. Sự lẫn lộn giữa các giá trị có thể gây ra khủng hoảng về hệ quy chiếu đạo đức, đặc biệt tro